1995 - 2004 Amy Lee fundó la banda junto a Ben Moody. Ambos se conocieron en un campamento para jóvenes luego de que Ben la escuchó tocando I'd Do Anything for Love (But I Won't Do That) de Meat Loaf en el piano. En menos de un mes, ambos empezaron a realizar presentaciones acústicas en tiendas de libros y cafeterías. Tiempo después, grabaron dos EP: Evanescence EP (diciembre de 1998) y Sound Asleep (agosto de 1999).

En el 2000, Evanescence grabó Origin, demo que contiene tres canciones de su álbum debut posterior, Fallen, escritas por Amy y Ben Moody: "Whisper", "Imaginary" y "My Immortal". A pesar de que "Whisper" e "Imaginary" tuvieron muchas modificaciones antes de ser incluidas en Fallen, "My Immortal" no fué reversionada. Una versión de "My Immortal" con la banda completa estuvo disponible para ser descargada de la web oficial de la banda por aquellos que habían comprado una copia original de Fallen, por lo que era necesario descargar un programa verificador. Dicha versión está incluida en copias más recientes de Fallen, como la brasileña y argentina.

El 22 de octubre de 2003, el guitarrista dejó la banda debido a "diferencias creativas".Terry Balsamo, ex-integrante de Cold, reemplazó a Ben Moody como guitarrista y compositor

Desde 2006, Amy junto a Terry Balsamo, Adriana Castaneda y Nashla Abushaibeh empezaron a trabajar en un nuevo material para The Open Door, que fue lanzado el 3 de octubre de 2006. Amy también estuvo trabajando en la composición de música para la película "Las Crónicas de Narnia: el león, la bruja y el armario", pero fue rechazado por ser "muy oscuro y épico". Sin embargo, los productores de "Narnia" afirmaron que nunca le pidieron que compusiera música para la película y que no se había previsto incluir música de Evanescence en la banda sonora. Se especulaba que el material para Narnia había sido usado en varias de las canciones de The Open Door, pero Amy afirmó que esto no era cierto, excepto por la introducción de la última canción del álbum, "Good Enough".

Actualmente, Amy colaboró creando un cover titulado "Sally's Song" (en español, "La canción de Sally") para "Nightmare Revisited", una colección de covers realizados por bandas y artistas de la actual escena musical. En Junio del 2009, Amy confirmó mediante Evanescence.com que ha estado trabajando en material nuevo de Evanescence para un lanzamiento aproximadamente para el año 2010.